Su construcción fue encargada por los Reyes Católicos al arquitecto Juan Guas para conmemorar su victoria en la Batalla de Toro en 1476, en un principio se planteó como lugar de enterramiento de los Reyes Católicos.

Pertenece a la orden de los franciscanos, y se construyó en estilo gótico isabelino, el claustro es del gótico tardío y la techumbre de tipo alfarje de la segunda planta de estilo mudéjar.

La iglesia tiene una sola nave de cúpula estrellada. Destacan también los grandes escudos de los Reyes católicos sostenidos por enormes águilas.

Este templo también es conocido como San Juan de las Cadenas ya que en su fachada exterior cuelgas cadenas que pertenecieron a los cautivos cristianos rescatados de las batallas de Málaga y Almería en el año 1485, y que llevaron a Toledo en agradecimiento a Dios por haber sido liberados de los árabes.