La sinagoga del tránsito fue construida por Samuel ha-Leví, Tesorero de Pedro I de Castilla a mediados del siglo S. XIV (1.366) y está situada en el barrio judío, al oeste de la ciudad .

Su interior está formado por elementos clásicos mudéjar (las yeserias, la madera tallada y la cerámica vitrificada)

Al entrar nos encontramos con un enorme "salón" de oración. Aqui se celebraban cultos tres veces al día, donde los varones judíos se sentaban frente al muro sagrado. Al lado de esa sala, los rabinos enseñaban la Torah, ley que regula los ritos y rige todos los aspectos de la vida judía.

Tras la expulsión de los judíos en 1.459 dejó de ser sinagoga y pasó a la orden de Calatrava y luego a la de Alcántara. Siglos más tarde, queda convertida en ermita dedicada al Tránsito de Nuestra Señora, conservando el archivo de las órdenes de Calatrava y de Alcántara. Durante las guerras napoleónicas se utilizó como barracón militar. En 1877 fue declarada monumento nacional.

En la actualidad en este edificio se encuentra el Museo Sefardí, que recoge muestras del pasado judío en la España anterior a 1492 sobre la lengua, cultura y costumbres de los "sefardíes".

Pero lo más importante de la sinagoga del Tránsito son sus inscripciones hebraicas, unas son bíblicas, con pasajes tomados de los salmos, y otras son históricas, con dedicatorias al constuctor de la sinagoga, Samuel ha-Leví, y al Rey Pedro I de Castilla